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質(zhì)粒DNA分離方法比較

更新時(shí)間:2017-07-26點(diǎn)擊次數(shù):2362

 

發(fā)酵后的E.Coli培養(yǎng)液

用低速大容量冷凍離心機(jī),大容量甩平或角式轉(zhuǎn)頭(3000~6000rpm,30~15min)或高速連續(xù)流轉(zhuǎn)頭(10000~18000rpm,流量300~600ml/min)

E.Coli菌體沉淀

用溶菌酶破細(xì)胞壁

用表面活性劑破細(xì)胞膜(如Triton X-100,SDS等)

大部分染色體DNA粘附在膜蛋白上,用一定濃度的鹽溶液(如1 mol NaCl 或1 mol 醋酸鈉)溶解后臺(tái)式高速離心機(jī)(Eppendorf管10000rpm,10min)或高速冷凍離心機(jī)10000~12000rpm×10min,上清中大部分為染色體DNA,沉淀中含質(zhì)粒DNA,降解的質(zhì)粒DNA,RNA及蛋白質(zhì)

 

在沉淀中加入異丙醇得到粗制的質(zhì)粒DNA

 

沉淀中加入TE緩沖液(pH8.0)

 

粗制DNA在-20℃在重力狀態(tài)喜愛(ài)沉淀15min以上,高速離心機(jī)12000rpm(近15000g)4℃離心5min去上清

 

用苯酚抽提去蛋白質(zhì)或用分子篩去蛋白質(zhì)

 

用RNA酶降解RNA

真空中抽去異丙醇,溶液中加入TE緩沖液

 

 

過(guò)柱(聚丙烯酰胺)RNA留柱,質(zhì)粒DNA過(guò)柱

加入E.B及Triton X-100,在CsCl中(預(yù)制梯度或平衡等密度離心,自形成梯度)用角轉(zhuǎn)頭,近垂直轉(zhuǎn)頭做超速離心(見(jiàn)文獻(xiàn)10)

 

 

較純的質(zhì)粒DNA,但含有5~10%的染色體DNA和降解的DNA片段

剩余的蛋白質(zhì)上浮,RNA沉淀,染色體DNA在離心管中上部形成區(qū)帶,質(zhì)粒DNA在離心管中下部形成純樣品區(qū)帶

 

 

 

 

密度梯度儀或其他簡(jiǎn)易方法從離心管中抽出,經(jīng)過(guò)帶流動(dòng)池的分光光度計(jì)后分部收集,從吸光度峰可以判斷質(zhì)粒DNA所在的位置

 

 

 

 

去CsCl,去其他組分得到高純度質(zhì)粒DNA

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